NAP

由中国科学院上海药物所张乃霞和朱维良课题组联合开发

NAP(NMR Aided Pharma)一套集核磁共振与计算机模拟于一体的软件平台,旨在快速、准确地表征蛋白质-配体的结合模式,显著提升核磁共振在蛋白质-配体作用模式解析领域的实用性。该平台结合[1H, 15N]-HSQC谱图的化学位移扰动分析(CSP)、分子对接与顺磁弛豫增强实验(PRE),通过可视化图形界面实现自动化的数据分析和构象筛选,大幅提高蛋白质-配体作用模式的解析效率与可靠性。

 

 

 

本平台的预期应用包括:

  • 结构生物学研究。科研人员借助软件平台可快速识别蛋白质-配体复合物的结合位点和结合模式,该方法尤其适用于传统方法难以处理的弱相互作用或瞬态复合物体系。
  • 药物研发与分子设计。借助该软件平台可精准定位药物结合热点区域,辅助先导化合物的优化与构效关系分析,为理性药物设计提供强有力的数据支持。
  • 人工智能模型构建与验证。本平台可为AI驱动的药物设计模型提供高质量实验数据支持,推动核磁共振与人工智能的深度融合。
  • 标准化科研服务平台
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    本软件平台面向结构药理、化学生物学等领域,提供模块化、易用的标准化分析服务,显著提高科研人员的数据处理效率与研究产出。

     

     

    相关成果

  • Shi, L.#; Xu, Z.#; Chen, X.; Meng Q.; Zhou H.; Xiong B.; Zhang, N.*; Sertraline and Astemizole Enhance the Deubiquitinase Activity of USP7 by Binding to Its Switching Loop Region. J Med Chem. 2025, 68(5), 5874-5890. DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00032
  • Zhong Y.#; Shi L.#; Xu Z.#; Gao J.; Ma Q.; Gao T.; Tang J.; Xiong M.; Xu Y.; Dai H.; Zhou H.; Zhang N.*; Zhou C.*;Benzbromarone interferes with the interaction between HSP90 and Aha1 by interacting with both of them. Commun Biol. 2025, 8(1):761. DOI:10.1038/s42003-025-08189-3